DR-391 Identifying cancer causing regulators using high throughput transcriptomics and whole-genomics data
Here, we propose to identify the link between noncoding regulatory mutations and the aberrantly activated regulatory proteins in cancer cells that implement the dysregulatory programs, using both whole genome and gene expression datasets. Previous studies have focused primarily on coding mutations, but the dysregulatory cellular programs that create and sustain cancer are not well studied. Through combined whole-genome and -transcriptome analyses, we aim to identify the key regulatory proteins orchestrating dysregulation in cancer cells. The findings will elucidate novel mechanistic details of dysregulation in cancer and facilitate drug development and precision medicine.
Felix Dietlein, Chidren’s Hospital Boston, USA
Terug naar nieuwsMeer nieuws
Patiënt profiteert van meer specialisatie in de kankerzorg
De behandelmogelijkheden nemen snel toe. Medisch specialisten in de kankerzorg moeten zich daarom verder specialiseren. Dat zegt Irene Dingemans van …
Elke patiënt krijgt zijn eigen medicijn dankzij databank
In een laboratorium in Amsterdam wordt voor het eerst op grote schaal DNA van kankerpatiënten verzameld. Het doel: leren van …
Whole genome sequencing geeft vaak uitsluitsel over primaire origine en tumortype
“Voor het geven van de juiste behandeling van kanker wil je weten waar de primaire tumor zich bevindt en wat …
We willen het maximum aan informatie uit de tumor van de patiënt halen. Deze DNA-test is daarvoor het best beschikbare instrument. Er is maar één keer weefsel, een biopt, met voldoende tumorcellen nodig. Omdat het hele genoom wordt onderzocht, ook de gebieden in het DNA waarvan we nu nog niet weten of de gevonden afwijkingen belangrijk zijn, is deze DNA-test tumortype onafhankelijk en toekomstbestendig. Deze eigenschappen zijn de twee belangrijkste eigenschappen van WGS.