A practical framework and online tool for mutational signature analyses show intertissue variation and driver dependencies
- Algoritmes
- Behandeling op maat
- Betaaltitel
- Biomarker
- cfDNA
- DNA
- Educatie
- Geen onderdeel van een categorie
- GENAYA project
- Hartwig Medical Database
- Hartwig Medical Foundation
- Hergebruik data
- Innovatie
- IT
- Kwaliteit
- Lab proces
- Lerend zorgsysteem
- Medicijn
- Moleculaire diagnostiek
- OncoAct
- Onderzoek
- Participerende ziekenhuizen
- Pipeline
- Preventie
- Primaire Tumor Onbekend
- Uitbehandeld
- Verhalen patiënten
- Werken in de cloud
- Wetenschappelijke publicaties
- Whole genome sequencing
- Zeldzame kankers
A practical framework and online tool for mutational signature analyses show intertissue variation and driver dependencies
Andrea Degasperi, Tauanne Dias Amarante, Jan Czarnecki, Scott Shooter, Xueqing Zou, Dominik Glodzik, Sandro Morganella, Arjun S. Nanda, Cherif Badja, …
Impact of DNA damage repair defects on response to radium-223 and overall survival in metastatic castration-resistant prostate cancer
Maarten J. Van Der Doelen, Pedro Isaacsson Velho, Peter H.J. Slootbeek, Samhita Pamidimarri Naga, Maren Bormann, Sjoerd Van Helvert, Leonie …
Impact of panel design and cut-off on tumour mutational burden assessment in metastatic solid tumour samples
CPCT Consortium, Joanne M. Mankor, Marthe S. Paats, Floris H. Groenendijk, Paul Roepman, Winand N. M. Dinjens, Hendrikus J. Dubbink, …
Pervasive chromosomal instability and karyotype order in tumour evolution
Thomas B. K. Watkins, Emilia L. Lim, Marina Petkovic, Sergi Elizalde, Nicolai J. Birkbak, Gareth A. Wilson, David A. Moore, …
DNA mismatch repair promotes APOBEC3-mediated diffuse hypermutation in human cancers
David Mas-Ponte & Fran Supek Nature Genetics, 2020, DOI
The Immunogenic Potential of Recurrent Cancer Drug Resistance Mutations: An In Silico Study
Marco Punta, Victoria A. Jennings, Alan A. Melcher & Stefano Lise Frontiers in Immunology, 2020, DOI
A compendium of mutational cancer driver genes
Francisco Martínez-Jiménez, Ferran Muiños, Inés Sentís, Jordi Deu-Pons, Iker Reyes-Salazar, Claudia Arnedo-Pac, Loris Mularoni, Oriol Pich, Jose Bonet, Hanna Kranas, …
Study protocol: Whole genome sequencing Implementation in standard Diagnostics for Every cancer patient (WIDE)
Kris G. Samsom, Linda J. W. Bosch, Luuk J. Schipper, Paul Roepman, Ewart De Bruijn, Louisa R. Hoes, Immy Riethorst, …
Pan-cancer landscape of homologous recombination deficiency
Luan Nguyen, John W. M. Martens, Arne Van Hoeck & Edwin Cuppen Nature Communications, 2020, DOI
A deep learning system accurately classifies primary and metastatic cancers using passenger mutation patterns
Wei Jiao, Gurnit Atwal, Paz Polak, Rosa Karlic, Edwin Cuppen, PCAWG Tumor Subtypes and Clinical Translation Working Group, Fatima Al-Shahrour, …
Mutational signature in colorectal cancer caused by genotoxic pks+ E. coli
Cayetano Pleguezuelos-Manzano, Jens Puschhof, Axel Rosendahl Huber, Arne Van Hoeck, Henry M. Wood, Jason Nomburg, Carino Gurjao, Freek Manders, Guillaume …
svMIL: predicting the pathogenic effect of TAD boundary-disrupting somatic structural variants through multiple instance learning
Marleen M. Nieboer & Jeroen De Ridder Bioinformatics, 2020, DOI
Een complete genetische analyse zou onderdeel moeten zijn van de standaarddiagnostiek bij iedere patiënt met kanker. Dat draagt bij aan een beter, afgestemd behandeladvies. Zo verminderen we over- en onderbehandeling, maken we tegelijkertijd de zorg kosten-effectiever en houden we hem betaalbaar.