DR-369 A method to infer substitution mutational signatures while correcting for local mutation rates biases
Vulnerability of the DNA to damage is influenced by (epi)genomic features and tissue specific properties of the DNA repair machinery. As a result, local mutation distributions differ across cancer types. Currently, implemented methods inferring mutational signatures disregard such diversity, thus limiting the comparison of mutational processes across cancers. We have implemented a solution overcoming this limitation, and plan to use whole genome-sequenced cancer data from HMF consortium to validate our method. We expect to release mutational signatures better suited at describing the activity of mutational processes across cancer types, thereby facilitating the investigation of their etiology and the translation to the clinic.
Maria Cartolano, University Hospital Cologne, Germany
Terug naar nieuwsMeer nieuws
Samenwerking als basis voor snellere, betere en betaalbare diagnostiek
Voor de CEO van GenomeScan Kees van den Berg is de samenwerking van zijn organisatie met Hartwig Medical Foundation essentieel …
SAGE: Nieuw algoritme voor analyse van tumor-DNA onthult mutaties die eerder niet waren gevonden
Hartwig Medical Foundation analyseert tumor-DNA. Dit proces proberen we continu te verbeteren. We delen deze analyses met ziekenhuizen om hen …
Advies van Zorginstituut over Plaatsbepaling Moleculaire Diagnostiek leidt helaas niet tot concrete maatregelen – Positie Hartwig Medical Foundation
Op 19 mei 2021 stuurde minister Van Ark voor Medische Zorg het advies van het Zorginstituut Nederland over Plaatsbepaling Moleculaire …
We zijn trots dat we samen met Hartwig Medical Foundation de uitgebreide DNA-test gereed hebben gemaakt voor gebruik in de standaarddiagnostiek. Bovendien levert de DNA-test belangrijke informatie op voor een lerend zorgsysteem waarin we toekomstige patiënten nog beter kunnen behandelen.