DR-384 The influence of the germline deletion polymorphism of chromosome 8 (ADAM3A/ADAM5 locus) on the expression of genes and pathways involved in carcinogenesis
Our data from 218 patients with esophageal adenocarcinoma (EAC) , treated with neo-adjuvant chemoradiotherapy (CROSS schema), show a worse prognosis in patients who present with a homozygous germline deletion polymorphism of the ADAM3A/ADAM5 gene locus. In this study we would like to get a mechanistic insight in to how this germline deletion polymorphism can lead to a poor prognosis by effecting the expression of other genes and pathways involved in carcinogenesis. We don’t know if the putative expression quantitative trait locus (eQTL) is (tumor)tissue specific, therefore we will perform eQTL analysis to asses relationship between the genotype of the overall survival risk locus (ADAM3A/ADAM5) with expression of nearby genes in EAC and other cancer patients grouped per tumor type.
Roelof Koster, Stichting Het Nederlands Kanker Instituut – Antoni van Leeuwenhoek Ziekenhuis, the Netherlands
Terug naar nieuwsMeer nieuws
Wordt whole genome sequencing van tumorweefsel standaard diagnostiek bij kanker?
11 juli 2019 Het Antoni van Leeuwenhoek, UMC Utrecht en Hartwig Medical Foundation onderzoeken of het uitlezen van het hele tumor-DNA …
Hartwig Medical Foundation verwelkomt nieuwe algemeen directeur
Hartwig Medical Foundation is verheugd om te melden dat Robert Jan Lamers op 1 september is gestart als haar nieuwe algemeen directeur. Hij …
Data van private naar public cloud
Vanaf januari 2020 gaat Hartwig Medical Foundation voor de dataprocessing en -opslag over van een private cloud infrastructuur naar een …
Kankers zullen steeds vaker voldoen aan de definitie van ‘zeldzaam’ als het gaat om de moleculaire profielen die elke tumor uniek maakt. Hoe meer onderzoek we hiernaar doen, hoe beter we in de toekomst elke patiënt een op maat gemaakte behandeling kunnen aanbieden. Whole genome sequencing en studies als DRUP leveren hier een belangrijke bijdrage aan.