DR-384 The influence of the germline deletion polymorphism of chromosome 8 (ADAM3A/ADAM5 locus) on the expression of genes and pathways involved in carcinogenesis
Our data from 218 patients with esophageal adenocarcinoma (EAC) , treated with neo-adjuvant chemoradiotherapy (CROSS schema), show a worse prognosis in patients who present with a homozygous germline deletion polymorphism of the ADAM3A/ADAM5 gene locus. In this study we would like to get a mechanistic insight in to how this germline deletion polymorphism can lead to a poor prognosis by effecting the expression of other genes and pathways involved in carcinogenesis. We don’t know if the putative expression quantitative trait locus (eQTL) is (tumor)tissue specific, therefore we will perform eQTL analysis to asses relationship between the genotype of the overall survival risk locus (ADAM3A/ADAM5) with expression of nearby genes in EAC and other cancer patients grouped per tumor type.
Roelof Koster, Stichting Het Nederlands Kanker Instituut – Antoni van Leeuwenhoek Ziekenhuis, the Netherlands
Terug naar nieuwsMeer nieuws
‘Een grote datasnoepwinkel die veel energie geeft aan artsen én onderzoekers’
Harmen van de Werken – Managing Director van het Cancer Computational Biology Center (CCBC) en Universitair Docent Afdeling Urologie van …
We weten steeds beter welk middel goed werkt bij welke patiënt
14 maart 2019, Van fundamenteel onderzoek naar personalised medicine bij kankerInterview Edwin Cuppen, wetenschappelijk directeur Hartwig Medical Foundation op de …
‘Om echt te weten hoe kanker ontstaat, heb je gegevens van echte patiënten nodig’
Onderzoeker over datagebruik Ruben van Boxtel, senior post-doc bij het Center for Molecular Medicine van het UMC Utrecht maakt gebruik …
De kennis die we met WGS vergaren kan ons een stap dichterbij ons doel brengen om voor elke patiënt een effectieve en passende behandeling te vinden, niet op basis van ‘one size fits all’, maar aangepast aan de kenmerken van de patiënt en de tumor.