DR-460- Identifying the mutational burden of tumor specific regulatory elements (REs) in breast cancer
Gene regulation is controlled by regulatory elements (REs) which are present in the non-coding regions of the genome. Accessibility of the genome is a proxy for the location of active REs. DNA motifs at accessible locations indicate which transcription factors can bind there. Mutations in DNA motifs can indicate a changed binding affinity which can affect gene expression. This project focuses on identifying genomic mutations that are overrepresented in BRCA specific REs, identified through ATAC-seq of primary tumors. HMF BRCA data will be used to confirm results, and to investigate the importance of these mutations in the metastatic setting.
Elzo de Wit, Netherlands Cancer Institute
Terug naar nieuwsMeer nieuws
Zeldzame kanker en niet-zeldzame kanker: even veel behandelmogelijkheden gevonden na DNA-test tumor
24% van alle mensen met kanker heeft een zeldzame vorm van kanker. In de huidige praktijk heeft deze groep patiënten …
Betere oncologische zorg vereist goed gebruik van data
Wanneer je de diagnose kanker krijgt kom je al snel terecht in een medische molen van behandelingen, medicijnen en opnames. …
Ontrafeling genetisch mechanisme achter tumorvorming kan gerichte behandeling van kankerpatiënten verbeteren
Genetische veranderingen in het FGFR2 gen komen voor in verschillende kankertypes en vormen een veelbelovend aanknopingspunt voor behandeling. Het effect …
Kanker ontstaat door mutaties in het DNA. Er zijn steeds meer geneesmiddelen die werkzaam zijn bij specifieke fouten in het DNA van de tumor van een individuele patiënt. Een medicijn dat niet past als een sleutel in het slot werkt niet, terwijl je wel het risico van de bijwerkingen hebt.