DR-535 An integrative framework to infer candidate synthetic lethal genetic interactions in Dutch cancer genomes
The objective of this study is to infer candidate genetic interactions (combinations of two mutated genes with advantageous or synthetic lethal effect) in cancer genomes to uncover new therapeutic targets and cancer biology. The inference of genetic interactions is performed by a variant-integration framework we are developing and currently testing by only using pediatric cancer genome WGS and RNA-Seq data from the Princess Máxima Centre for pediatric oncology. This framework tests mutated genes and utilizes and integrates all types of gene variants; SNVs, indels, SVs, CNVs, and gene-fusions to leverage a more comprehensive representation of the genomic landscape and increase finding candidate genetic interactions.
Patrick Kemmeren, Prinses Maxima Centrum, The Netherlands
Terug naar nieuwsMeer nieuws
GLOW: werken aan meer behandelopties voor het glioblastoom
De vooruitzichten voor patiënten met een glioblastoom zijn al jaren ongunstig, en de behandelopties blijven beperkt. Reden om in de …
GLOW-studie eindigt – maar WGS blijft waardevol voor patiënten met glioblastoom
Per 1 oktober 2025 wordt de GLOW-studie officieel beëindigd. De tussentijdse analyse heeft onder medisch specialisten een groeiend enthousiasme laten …
‘Data Hartwig short cut voor onderzoek naar chemoresistentie ovariumkanker’
Wigard Kloosterman, associate professor UMC Utrecht afdeling genetica (Center for Molecular Medicine) ‘Al een paar jaar zijn we bezig met …
Het aantal WGS- samples dat Hartwig Medical Foundation heeft, is uniek in het onderzoeksveld en groeit snel. Toen we begonnen waren het er 3.500 en dat zijn er nu al meer dan 5.000.