DR-535 An integrative framework to infer candidate synthetic lethal genetic interactions in Dutch cancer genomes
The objective of this study is to infer candidate genetic interactions (combinations of two mutated genes with advantageous or synthetic lethal effect) in cancer genomes to uncover new therapeutic targets and cancer biology. The inference of genetic interactions is performed by a variant-integration framework we are developing and currently testing by only using pediatric cancer genome WGS and RNA-Seq data from the Princess Máxima Centre for pediatric oncology. This framework tests mutated genes and utilizes and integrates all types of gene variants; SNVs, indels, SVs, CNVs, and gene-fusions to leverage a more comprehensive representation of the genomic landscape and increase finding candidate genetic interactions.
Patrick Kemmeren, Prinses Maxima Centrum, The Netherlands
Terug naar nieuwsMeer nieuws
Nieuwe behandeloptie bij RET, maar nu de testen nog
De goedkeuring door het European Medicines Agency van selpercatinib als tweedelijns behandeling voor patiënten met gevorderd RET-positief niet-kleincellig longkanker biedt nieuw …
Groeifonds investeert 325 miljoen euro in Oncode-PACT om ontwikkeling kankermedicijnen te versnellen
Het Nationaal Groeifonds investeert in totaal 325 miljoen euro in het plan van Oncode-PACT om het preklinische ontwikkelproces van kankermedicijnen …
E-learning moleculaire diagnostiek online
Dankzij snelle ontwikkelingen in de moleculaire diagnostiek wordt personalised medicine in de oncologie steeds vaker toegepast. U kunt hierover nu een e-learning volgen …
Bij zeldzame kankers is het belangrijk om het DNA te ontrafelen. 21% van de mensen met kanker heeft een zeldzame vorm.