DR-073 Making HMF colorectal cancer data accessible for the HMF CRC focus group through cBioPortal
“Colorectal cancer (CRC) is the second most common cause of cancer death worldwide. Cancer is caused by DNA alterations. Detailed information about DNA alterations in tumors from clinically well-characterized CRC patients offers excellent opportunities for translational research. The main purpose of this project is to facilitate querying and viewing of the HMF CRC data by members of the HMF focus group, allowing individual researchers to easily judge whether the HMF CRC dataset is (not) suited to address their specific research question(s).
Data:
• DNA whole genome sequencing data from CRC samples, indicative for the landscape of genomic aberrations in CRC patients.
• RNA sequencing data, indicative for biological consequences of DNA alterations.
• Clinical and pathological data, to relate DNA mutations and RNA expression data to clinical characteristics.
Relevance for patient:
Easy querying and viewing of HMF CRC data in cBioPortal will stimulate the use of HMF CRC data for translational research purposes. Facilitating initiation of discovery and validation studies will ultimately lead to better disease management of CRC patients.”
Remond Fijneman NKI-AvL the Netherlands
Terug naar nieuwsMeer nieuws

Uitgebreide DNA-test vergoed voor patiënten met PTO
Sinds afgelopen april wordt de uitgebreide DNA-test vergoed voor patiënten waarvan niet bekend is waar de primaire tumor zich bevindt. …

DNA-test voor kankerpatiënten met onbekende primaire tumor (PTO) mogelijk bij Erasmus MC Kankerinstituut
Het Erasmus MC Kanker Instituut zet whole genome sequencing, een uitgebreide DNA-test, in voor diagnostiek van mensen van wie de …

Hartwig zoekt internationale samenwerking op
Nu de gezondheidszorg steeds meer in de richting gaat van persoonlijke geneeskunde, speelt Whole Genome Sequencing (WGS) een cruciale rol …

Zolang de behandelaar niet weet waar de primaire tumor zit, heeft hij ook geen gerichte behandelmogelijkheid en kan ook geen inschatting worden gegeven hoe lang iemand nog heeft.