DR-073 Making HMF colorectal cancer data accessible for the HMF CRC focus group through cBioPortal

No Featured Image set

“Colorectal cancer (CRC) is the second most common cause of cancer death worldwide. Cancer is caused by DNA alterations. Detailed information about DNA alterations in tumors from clinically well-characterized CRC patients offers excellent opportunities for translational research. The main purpose of this project is to facilitate querying and viewing of the HMF CRC data by members of the HMF focus group, allowing individual researchers to easily judge whether the HMF CRC dataset is (not) suited to address their specific research question(s).

Data:
• DNA whole genome sequencing data from CRC samples, indicative for the landscape of genomic aberrations in CRC patients.
• RNA sequencing data, indicative for biological consequences of DNA alterations.
• Clinical and pathological data, to relate DNA mutations and RNA expression data to clinical characteristics.

Relevance for patient:
Easy querying and viewing of HMF CRC data in cBioPortal will stimulate the use of HMF CRC data for translational research purposes. Facilitating initiation of discovery and validation studies will ultimately lead to better disease management of CRC patients.”

Remond Fijneman NKI-AvL the Netherlands

Terug naar nieuws

Meer nieuws

Primaire Tumor Onbekend – landelijke samenwerking hard nodig

Primaire Tumor Onbekend – landelijke samenwerking hard nodig

14-05-2020

Elke week krijgen gemiddeld 25 patiënten een diagnose kanker met uitzaaiingen terwijl de bron van de tumor zelf niet gevonden …

‘Om echt te weten hoe kanker ontstaat, heb je gegevens van echte patiënten nodig’

‘Om echt te weten hoe kanker ontstaat, heb je gegevens van echte patiënten nodig’

04-09-2017

Onderzoeker over datagebruik Ruben van Boxtel, senior post-doc bij het Center for Molecular Medicine van het UMC Utrecht maakt gebruik …

22 Belangrijke wetenschappelijke publicaties in 2022 

22 Belangrijke wetenschappelijke publicaties in 2022 

06-01-2023

In 2022 hebben 22 onderzoeksgroepen hun onderzoek met onder andere data uit de Hartwig Medical database gepubliceerd in toonaangevende wetenschappelijke …

Wilt u op de hoogte blijven van nieuwe ontwikkelingen?

Abonneer u op onze nieuwsbrieven

Meer weten over de complete DNA-test?

Ga naar OncoAct.nl