DR-248 Essential regulatory elements on high-level amplicons
Only 2% of the human genome contains protein-coding genes. Their expression depends on the regulatory elements in the surrounding “non-coding” genome. High-level amplifications frequently are extrachromosomal amplicons (ecDNA) and their presence in a cancer is associated with worse outcomes for the patient. They include oncogenes that promote cancer growth and regulatory elements, all stitched together into a small circle. The HMF whole genome sequencing data will allow us to reveal exactly which loci are included in ecDNA. In this project, we propose to investigate which specific regulatory elements are required by ecDNAs to drive aggressive tumor growth.
Anton Henssen, Charité – Universitätsmedizin Berlin, Germany
Terug naar nieuwsMeer nieuws
Wordt whole genome sequencing van tumorweefsel standaard diagnostiek bij kanker?
11 juli 2019 Het Antoni van Leeuwenhoek, UMC Utrecht en Hartwig Medical Foundation onderzoeken of het uitlezen van het hele tumor-DNA …
Elke patiënt krijgt zijn eigen medicijn dankzij databank
In een laboratorium in Amsterdam wordt voor het eerst op grote schaal DNA van kankerpatiënten verzameld. Het doel: leren van …
Whole genome sequencing is betrouwbaar, heeft toegevoegde waarde en is prima in te bedden in de dagelijkse pathologie-diagnostiek
Bron: website AvL Voor patiënten met kanker worden doorlopend medicijnen ontwikkeld die specifiek aangrijpen op een DNA-fout in hun tumor. …
Als je WGS één keer doet bij een patiënt met gemetastaseerde kanker, weet je meteen alles wat je nodig hebt om een gerichte behandeling te bieden als die – geregistreerd of in onderzoeksetting – beschikbaar is.