DR-339 Analysis of the break rate profiles of metastatic solid tumours to investigate genomic enrichment of structural variants
We recently developed statistical framework, named Katdetectr, that robustly detects clustered somatic mutations (kataegis) in the DNA from cancer cells. In this proposed project we aim to use the katdetectr framework, to analyse a different type of mutation called Structural Variants (SV). Using this approach, we can construct the Break Rate Profile (BRP) of a sample. Subsequently, BRP across samples can be further analysed which can reveal novel biological features and recurrent patterns. These insights help our understanding of cancer and aid in the discovery of new therapies.
John Martens, Erasmus MC, the Netherlands
Terug naar nieuwsMeer nieuws
‘Data Hartwig short cut voor onderzoek naar chemoresistentie ovariumkanker’
Wigard Kloosterman, associate professor UMC Utrecht afdeling genetica (Center for Molecular Medicine) ‘Al een paar jaar zijn we bezig met …
Medicalfacts: onderzoek naar optimale inzet van genetische testen voor “Immunotherapie” bij kanker
Momenteel komen er in toenemende mate nieuwe, vaak dure, medicijnen tegen kanker op de markt. Behandelingen die nu worden gegeven …
Toename darmkanker bij jongvolwassenen: vraagt dit om een andere behandeling?
Recent verscheen in het nieuws dat de incidentie van darmkanker bij jongvolwassenen (AYA’s, 18 t/m 39 jaar op het moment …
Kanker ontstaat door mutaties in het DNA. Er zijn steeds meer geneesmiddelen die werkzaam zijn bij specifieke fouten in het DNA van de tumor van een individuele patiënt. Een medicijn dat niet past als een sleutel in het slot werkt niet, terwijl je wel het risico van de bijwerkingen hebt.