DR-369 A method to infer substitution mutational signatures while correcting for local mutation rates biases
Vulnerability of the DNA to damage is influenced by (epi)genomic features and tissue specific properties of the DNA repair machinery. As a result, local mutation distributions differ across cancer types. Currently, implemented methods inferring mutational signatures disregard such diversity, thus limiting the comparison of mutational processes across cancers. We have implemented a solution overcoming this limitation, and plan to use whole genome-sequenced cancer data from HMF consortium to validate our method. We expect to release mutational signatures better suited at describing the activity of mutational processes across cancer types, thereby facilitating the investigation of their etiology and the translation to the clinic.
Maria Cartolano, University Hospital Cologne, Germany
Terug naar nieuwsMeer nieuws
Hartwig ontvangt CE-markering voor softwareoplossing OncoAct
Hartwig Medical Foundation heeft een IVDR CE-markering verkregen voor Hartwig Medical OncoAct (OncoAct), haar softwareoplossing voor kankerdiagnostiek op basis van …
DNA-analyse voor therapie op maat
27 februari 2019 Mensen met een minder voorkomende kankersoort en patiënten die zijn uitbehandeld komen mogelijk in aanmerking voor een …
Tussenstand onderzoek naar hersentumoren: 50 patiënten geïncludeerd
In augustus 2022 zijn we gestart met de GLOW-studie. Wat is de stand van zaken? Hoe nu verder? We hopen …
Door WGS hebben we in de moleculaire diagnostiek op onze afdeling een stap gemaakt van de analyse van minder dan 100 genen naar circa 20.000 genen per patiënt. Dat levert ontzettend veel waardevolle informatie, niet alleen voor de patiënt van vandaag, maar ook voor de patiënt van de toekomst.