DR-369 A method to infer substitution mutational signatures while correcting for local mutation rates biases
Vulnerability of the DNA to damage is influenced by (epi)genomic features and tissue specific properties of the DNA repair machinery. As a result, local mutation distributions differ across cancer types. Currently, implemented methods inferring mutational signatures disregard such diversity, thus limiting the comparison of mutational processes across cancers. We have implemented a solution overcoming this limitation, and plan to use whole genome-sequenced cancer data from HMF consortium to validate our method. We expect to release mutational signatures better suited at describing the activity of mutational processes across cancer types, thereby facilitating the investigation of their etiology and the translation to the clinic.
Maria Cartolano, University Hospital Cologne, Germany
Terug naar nieuwsMeer nieuws
AMA-sessie – nieuwe datum: donderdag 30 oktober
Let op: de AMA (Ask Me Anything)-sessie die gepland stond voor dinsdag 16 september wordt verplaatst naar donderdag 30 oktober, online, van …
Zorgpad Brede moleculaire diagnostiek aangenomen, belangrijke stap voor patiënten met kanker
Op Wereldkankerdag stonden we samen stil bij de enorme impact van kanker. Maar die impact zien we elke dag. Bij patiënten, naasten, …
ASCO 2021: Presentaties whole genome sequencing
Op het congres van de American Society of Clinical Oncology (ASCO) van 4-8 juni 2021 hebben onderzoekers Kris Samsom en …
Een complete genetische analyse zou onderdeel moeten zijn van de standaarddiagnostiek bij iedere patiënt met kanker. Dat draagt bij aan een beter, afgestemd behandeladvies. Zo verminderen we over- en onderbehandeling, maken we tegelijkertijd de zorg kosten-effectiever en houden we hem betaalbaar.