DR-369 A method to infer substitution mutational signatures while correcting for local mutation rates biases
Vulnerability of the DNA to damage is influenced by (epi)genomic features and tissue specific properties of the DNA repair machinery. As a result, local mutation distributions differ across cancer types. Currently, implemented methods inferring mutational signatures disregard such diversity, thus limiting the comparison of mutational processes across cancers. We have implemented a solution overcoming this limitation, and plan to use whole genome-sequenced cancer data from HMF consortium to validate our method. We expect to release mutational signatures better suited at describing the activity of mutational processes across cancer types, thereby facilitating the investigation of their etiology and the translation to the clinic.
Maria Cartolano, University Hospital Cologne, Germany
Terug naar nieuwsMeer nieuws
Catalogus maakt Hartwig Medical Database beter doorzoekbaar
Hartwig Medical Foundation heeft een catalogus van de Hartwig Medical Database met DNA-data van het hele tumor genoom: https://catalog.hartwigmedicalfoundation.nl. De …
Certificaat databeveiliging vernieuwd
“Binnen alle pijlers in control” zei de beoordelaar bij de controle van onze databeveiliging. In vier dagen is de hele organisatie …
DNA-test voor kankerpatiënten met onbekende primaire tumor (PTO) mogelijk bij Erasmus MC Kankerinstituut
Het Erasmus MC Kanker Instituut zet whole genome sequencing, een uitgebreide DNA-test, in voor diagnostiek van mensen van wie de …
Als je WGS één keer doet bij een patiënt met gemetastaseerde kanker, weet je meteen alles wat je nodig hebt om een gerichte behandeling te bieden als die – geregistreerd of in onderzoeksetting – beschikbaar is.