Clinical validation of Whole Genome Sequencing for cancer diagnostics
- Algoritmes
- Behandeling op maat
- Betaaltitel
- Biomarker
- DNA
- Educatie
- Geen onderdeel van een categorie
- GENAYA project
- Hartwig Medical Database
- Hartwig Medical Foundation
- IT
- Kwaliteit
- Lab proces
- Lerend zorgsysteem
- Medicijn
- Moleculaire diagnostiek
- OncoAct
- Onderzoek
- Participerende ziekenhuizen
- Preventie
- Primaire Tumor Onbekend
- Uitbehandeld
- Verhalen patiënten
- Werken in de cloud
- Wetenschappelijke publicaties
- Whole genome sequencing
- Zeldzame kankers
Clinical validation of Whole Genome Sequencing for cancer diagnostics
Paul Roepman, Ewart de Bruijn, Stef van Lieshout, Lieke Schoenmaker, Mirjam C. Boelens, Hendrikus J. Dubbink, Willemina RR. Geurts-Giele, Floris …
“A systematic CRISPR screen defines mutational mechanisms underpinning signatures caused by replication errors and endogenous DNA damage”
Xueqing Zou, Gene Ching Chiek Koh, Arjun Scott Nanda, Andrea Degasperi, Katie Urgo, Theodoros I. Roumeliotis, Chukwuma A. Agu, Cherif …
RET Fluorescence In Situ Hybridization Analysis Is a Sensitive but Highly Unspecific Screening Method for RET Fusions in Lung Cancer
Teodora Radonic, MD, PhD, W. R. R. Geurts-Giele, PhD,b Kris G. Samsom, MD, Guido M. J. M. Roemen, BSc,Jan H. …
Whole genome sequencing of metastatic colorectal cancer reveals prior treatment effects and specific metastasis features
Pauline A. J. Mendelaar, Marcel Smid, Job van Riet, Lindsay Angus, Mariette Labots, Neeltje Steeghs, Mathijs P. Hendriks, Geert A. …
In silico saturation mutagenesis of cancer genes
Ferran Muiños, Francisco Martínez-Jiménez, Oriol Pich, Abel Gonzalez-Perez, Nuria Lopez-Bigas Nature July 8, 2021 PMID: 34321661
A kinome‑centered CRISPR‑Cas9 screen identifies activated BRAF to modulate enzalutamide resistance with potential therapeutic implications in BRAF‑mutated prostate cancer
Sander A. L. Palit, Jeroen van Dorp, Daniel Vis, Cor Lieftink, Simon Linder, Roderick Beijersbergen, Andries M. Bergman, Wilbert Zwart, …
Learning mutational signatures and their multidimensional genomic properties with TensorSignatures
Harald Vöhringer, Arne Van Hoeck, Edwin Cuppen, Moritz Gerstung Nature Communications June 15, 2021 PMID: 34131135
Radiotherapy is associated with a deletion signature that contributes to poor outcomes in patients with cancer
Emre Kocakavuk, Kevin J. Anderson, Frederick S. Varn, Kevin C. Johnson, Samirkumar B. Amin, Erik. P. Sulman, Martijn P. Lolkema, …
VIRUSBreakend: Viral Integration Recognition Using Single Breakends
Daniel L. Cameron, Nina Jacobs, Paul Roepman, Peter Priestley, Edwin Cuppen, Anthony T. Papenfuss Bioinformatics May 11, 2021 PMID: 33973999
Predicting patient response with models trained on cell lines and patient-derived xenografts by nonlinear transfer learning
Soufiane M. C. Mourragui, Marco Loog, Daniel J. Vis, Kat Moore, Anna G. Manjon, Mark A. van de Wiel, eMarcel …
Landscape of driver gene events, biomarkers, and druggable targets identified by whole-genome sequencing of glioblastomas
Wesley S. van de Geer, Youri Hoogstrate, Kaspar Draaisma, Pierre A. Robe, Sander Bins, Ron H.J. Mathijssen, Pim French, Harmen …
Patients with bi-allelic BRCA1/2 inactivation respond to olaparib treatment across histologic tumor types
Hanneke van der Wijngaart, Louisa R. Hoes, J. Maxime van Berge Henegouwen, Daphne L. van der Velden, Laurien J. Zeverijn, …
Door WGS hebben we in de moleculaire diagnostiek op onze afdeling een stap gemaakt van de analyse van minder dan 100 genen naar circa 20.000 genen per patiënt. Dat levert ontzettend veel waardevolle informatie, niet alleen voor de patiënt van vandaag, maar ook voor de patiënt van de toekomst.